《南部档案》的故事发生在民国时期的南洋与厦城一带。张海盐和张海虾是南部档案馆的年轻探员，他们受命追查一连串无法用常理解释的案件。从峇来神像、盐碱湖死亡事件到张瑞朴失踪，最初看似邪神传说的线索，逐渐牵出财宝、古文字、地下祖庭和被刻意隐藏的档案馆秘密。
随着调查深入，张海盐和张海虾登上南安号，发现这艘客轮并非普通交通工具，而是围绕黄昏草案布下的猎场。军阀势力、伪装身份、档案馆叛徒和杀手组织在船上交错出现，师兄弟一边逃避追杀，一边寻找幕后真相。张海琪、董小姐、何剪西等人物相继卷入，让南部档案馆的旧事与现实阴谋不断重叠。
剧集的主线不只是一次探案，也是一场关于身份、责任和牺牲的追寻。张海盐从轻佻机敏的探员，被迫面对同伴生死、档案馆覆灭和自己当年无意间埋下的祸根；张海虾则以冷静和默契不断为师弟留下线索。两人在危局中互相支撑，也一步步走向南部档案馆更深层的秘密。
后续故事从南安号延伸到厦城旧宅、海利银行和档案馆地下机关。黄昏草、假死药、墙缝入口、深海药材等设定，把民国悬疑、探险奇观和张家秘密结合在一起。张海盐为了救张海虾深入档案馆核心，也逐渐明白南部档案馆并非单纯办案机构，而是与张家血脉、南洋异闻和一代代探员使命紧密相连的隐秘系统。
《南部档案》以冒险悬疑为底色，通过张海盐、张海虾和张海琪之间的师门关系，串起军阀阴谋、档案馆旧案和南洋秘闻。故事在离奇案件和动作追逃之外，更强调探员之间的信任、愧疚与守护，让一场追查黄昏草的行动，逐渐变成寻找档案馆真相和重新承担使命的旅程。
《南部档案》根据南派三叔同名小说改编，是一部民国探险悬疑剧。剧集以南部档案馆探员张海盐、张海虾的调查行动为主线，将南洋异闻、军阀阴谋、档案馆旧案和张家秘密交织在一起。
故事主要围绕黄昏草案、南安号追杀、厦城档案馆旧址和地下机关展开，既有悬疑探案，也有兄弟情义和师门秘密。资料页剧情介绍已按整剧口吻整理，适合用于了解全剧主线与人物关系。
